System HiSeq 2500

Moc produkcyjna sekwencjonowania następnej generacji.

System HiSeq 2500
Opis ogólny

System HiSeq 2500 to potężny i ultrawydajny system do sekwencjonowania następnej generacji pozwalający na wykonywanie najszerszego spektrum aplikacji. Połączenie technologii SBS firmy Illumina oraz wysokiej wydajności i szybkości sprawia, iż system znajduje zastosowanie w licznych centrach genomowych oraz wiodących instytutach na całym świecie.

System HiSeq 2500 charakteryzuje się dwoma trybami pracy (szybkim oraz wysoce wydajnym) oraz możliwościa pracy z jedną lub dwoma jednocześnie płytkami do sekwencjonowania (flow cell). Tryb szybki (Rapid run) dostarcza szybkich wyników sekwencjonując ograniczoną ilość prób. Niższa wydajność jest wynagradzana krótkim czasem reakcji oraz długim odczytem nawet do 2x250bp. Dłuższy odczyt umożliwiający większą głębokość sekwencjonowania znacznie ułatwia wykonywanie aplikacji de novo oraz analiz metagenomicznych.

Tryb dużej wydajności (High output mode) to idealne rozwiązanie dla większych eksperymentów lub gdy wymagane jest znacznie większe pokrycie. Tryb wysokiej wydajności pozwala na zwielokrotnienie liczby prób co najmniej 6 razy w stosunku do trybu szybkiego umożliwiając szybkie i efektywne wykonywanie dużych projektów. Nowa wersja odczynników HiSeq SBS Kit v4 dostarcza 4 miliardy klastrów oraz generuje ponad 1Tb danych w ciągu 6 dni.

HiSeq 2500 to pierwszy wysokowydajny system do sekwencjonowania, gdzie wszystkie procesy takie, jak tworzenie klastrów, sekwencjonowanie w technologii SBS, analiza danych oraz przechowywanie wyników w BaseSpace Cloud są możliwe do wykonania z użyciem jednego urządzenia.

Specyfikacja techniczna
Wydajność systemu HiSeq 2500
AplikacjaTryb Rapid RunTryb High Ooutput
TruSeq v3TrueSeq v4
ChIP-seq
15mln odczytów
1x36bp
40 prób
7h
200 prób
2 dni
260 prób
29h
mRNA-seq
40mln odczytów
2x50bp
15 prób
16h
120 prób
5 dni
100 prób
2,5 dnia
Ludzki egzom (37Mb)
100x pokrycie
2x100bp
20 prób
27h
115 prób
10 dni
150 prób
5 dni
Ludzki genom
30x pokrycie
1 prób
27h
6 prób
11 dni
10 prób
6 dni
Genom de novo 2,5Gb
100x pokrycie
2x250bp
1 próba
60h
Przybliżone czas reakcji i wydajność (generowanie klastrów i sekwencjonowanie)
Tryb High Output
TruSeq v4TruSeq v3
2 Flow Cell1 Flow Cell2 Flow Cell2 Flow Cell1 Flow Cell2 Flow Cell
1x36bp128-144Gb64-72Gb29h95-105Gb47-52Gb2 dni
2x50bp360-400Gb180-200Gb2,5 dnia270-300Gb135-150Gb5,5 dnia
2x100bp720-800Gb360-400Gb5 dni540-600Gb270-300Gb11 dni
2x150bp900-1Tb450-500Gb6 dnibrak opcjibrak opcjibrak opcji
Ilość przefiltrowanych odczytów4 miliardy (SR)
8 miliardów (PE)
2 miliardy (SR)
4 miliardy (PE)
3 miliardy (SR)
6 miliardów (PE)
1,5 miliarda (SR)
3 miliardy (PE)
Jakość odczytów85% bp pow. Q30 przy 2×50bp
80% bp pow. Q30 przy 2×100bp
80% bp pow. Q30 przy 2×125bp
85% bp pow. Q30 przy 2×50bp
80% bp pow. Q30 przy 2×100bp
Tryb Rapid Run
2 Flow Cell1 Flow Cell2 Flow Cell
1x36bp18-22Gb9-11Gb7h
2x50bp50-60Gb25-30Gb16h
2x100bp100-120Gb50-60Gb27h
2x150bp150-180Gb75-90Gb40h
2x250bp250-300Gb125-150Gb60h
Ilość przefiltrowanych odczytów600 milionów (SR)
1,2 miliarda (PE)
300 milionów (SR)
600 milionów (PE)
Jakość odczytów85% bp pow. Q30 przy 2×50bp
80% bp pow. Q30 przy 2×100 bp
75% bp pow. Q30 przy 2×250 bp
Dokumenty